A Kyoto Distillery-t 2014-ben hozta létre a három alapító: Noriko Kakuda Croll, David Croll és Marcin Miller. Lehet, hogy a cég még gyerekcipőben jár, de az alapítók útja a világ egyik leginnovatívabb szeszfőzdéjének felépítésére mintegy 20 évvel ezelőtt kezdődött. Noriko és David az 1990-es évek végén alapított egy whisky-importőr társaságot Tokióban, hogy az igényes japán whisky-rajongókat megismertesse a független skót lepárlóüzemek kiváló single maltjával. Ebben a minőségben találkoztak Marcin Millerrel, aki akkoriban a Whiskey Magazine szerkesztője és kiadója volt. Együtt létrehozták a magazin japán nyelvű változatát, és 2000-ben elindították a Whisky Live whiskykóstoló eseményt.